Приоритетным направлением работы образовательных учреждений г.Алатыря становится формирование здорового образа жизни. Происходят позитивные изменения по созданию системы мер, содействующих сохранению и укреплению физического и психического здоровья детей средствами физической культуры и спорта. Разработана и реализуется целевая городская программа «Развитие физической культуры и спорта в системе образования г.Алатыря на 2004 - 2006 годы». Во всех общеобразовательных учреждениях города введен третий час физической культуры, который проводится в форме уроков плавания, хореографии, подвижных игр. Решается вопрос обеспечения двигательной активности учащихся до 6 - 8 часов в неделю. В спортивных секциях занимается около 35% школьников.

В системе образования функционируют 2 спортивные школы, которые специализируются на спортивной гимнастике, плавании и баскетболе. Они обеспечивают  физкультурно-оздоровительную работу  с детьми дошкольных образовательных учреждений и учащимися школ города. В спортивных школах  занимаются 878 человек. Лучшие воспитанники лидируют в республиканских, российских и международных соревнованиях.

Укрепляется учебно-материальная база образовательных учреждений. Второй год подряд город принимает активное участие в целевой федеральной программе по обеспечению образовательных учреждений спортивным оборудованием и инвентарем. В 2004 году школы получили спортивный инвентарь на 209 тысяч рублей, до конца года пополнится материальная база еще на 152 тысячи рублей. Приобретено современное спортивное оборудование для ДЮСШ № 1. Выполнены работы по капитальному ремонту системы отопления ДЮСШ № 1, подвесных потолков и кровли ДЮСШ № 2. В 2003 году введен в эксплуатацию пристрой на 250 ученических мест к школе № 9 со спортивным залом. В настоящее время готовится проектно-сметная документация на строительство спортивного зала к школе № 2.