В общеобразовательных учреждениях Алатыря развивается инновационная, проектная деятельность. Так, в средней школе  №  7  внедряется профилактический проект ХОУП «Полезные привычки», «Полезные навыки»,  «Полезный выбор»; школа участвует в республиканском эксперименте  по  совершенствованию структуры и содержания физической культуры.

Коллектив средней школы  №  11 четыре года реализует социальный проект «Школа – правовое пространство», является экспериментальной площадкой по проблемам правового образования, развитию детского общественного движения. Гимназия №  6 - победитель межрегионального конкурса социально-культурных проектов «Ярмарка – 2003».

А школа  № 3 - лауреат республиканского конкурса проектов «Я – гражданин», победитель республиканского конкурса вариативных  и  авторских программ по вопросам деятельности музея «Из пламени Афганиста». В этой же школе создан и активно действует попечительский совет.